• TÜBİTAK 1001 Projesi (2024-2027)

In siliko yöntemle Mycobacteriıum tuberculsosis’e karşı protein tirozin fosfataz A hedefli terapotik ajanların belirlenmesi ve in vitro etkinliklerinin araştırılması, Özlem Aydemir (Yürütücü), Özbek Sarica P. , Asuman Deveci Özkan, İhsan Hakkı Çiftçi, Gülay Erman, M. Koroğlu

 

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2023-II), Buse AKBULUT, Genis Spektrumlu (ESBL) OXA Enzimlerini Hedefleyen Yeni Inhibitörler

 

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2023-II), Doğuş Sönmez, Güneş Mine Şen, Yusuf Alp Güneş, Eskape patojenlerinde yaygın bulunan D-sınıfı beta laktamazlara karsı ortak inhibitörlerin belirlenmesi

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2023-II), İlsu Sedef Dernek, Dar spektrumlu OXA betalaktamaz enzimlerine etki edebilecek potansiyel inhibitörlerin kesfi

 

• TÜBİTAK 1001 Projesi (2023 - 2026) (123Z538 )

ESKAPE patojenlerinde yaygın bulunan D-sınıfı beta-laktamazlara karşı ortak inhibitörlerin belirlenmesi, Özbek Sarica P. (Yürütücü), Sariyar Akbulut B., Avci F. G. , Keskin Özkaya Z. Ö., Aksu M. B.

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2023-I) Emre Apaydın, Karbapenem hidroliz eden OXA enzimlerini hedefleyen ilaç tasarımı

 

• TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi (2021 - 2024)

Rasyonel tasarım ile Corynebacterium glutamicum?un L-DOPA üretimi için bir mikrobiyal hücre fabrikasına dönüstürülmesi ve LDOPA üretim prosesinin gelistirilmesi, Sariyar Akbulut B. (Yürütücü) , Sayar N. A. , Özbek Sarica P. , Kazan D.

 

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2022-II) Kerem Aylkut, Meningokok hastalığında bakteriyel virülansı hedef alan doğal bazlı ilaçların hesaplamalı yöntemler ile keşfi

 

• TÜBİTAK 2209 Projesi (2022-II) Ayten Sude Gülsay, Remziye Sümeyye Kurt, D sınıfı beta-laktamazlarda ligand bağlanma bölgesinin hesapsal analizi

 

• TÜBİTAK Uluslararası Çoklu İşbirliği Projesi (2021 - 2024)

Sürdürülebilir Biyoekonomi Için Gıda Ile Yarışan Sübstratların Metanol, CO2 ve Metilamin Ile DeğiştirilmesiSürdürülebilir Kalkınma, Sariyar Akbulut B. (Yürütücü) , Sayar N. A. , Özbek Sarica P.

 

• TÜBİTAK 1001 Projesi (2020 - 2023)

Tip 4 pili protein kompleksinin inhibisyonu ve inhibisyon dinamiğinin karakterizasyonu, Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü) , Özbek Sarıca P. , Avci F. G. , Keskin Özkaya Z. Ö.

 

• Diğer Resmi Kurumlarca Desteklenen Proje (TUSEB 3454)

Peptidlerle ilişkili bağışıklık sistemi proteinlerinin çalışma mekanizmalarının aydınlatılması, Özbek Sarıca P. (Yürütücü) , Sarıyar Akbulut B. (2020 - 2022)

 

• TÜBİTAK 1002 Projesi

Kolorektal kanserinde farklılaşan protein-protein etkileşimleri üzerinden ilaç repozisyonu, Arğa K. Y. (Yürütücü) , ÖZBEK SARICA P. (2019 - 2020)

 

• TÜBİTAK 1002 Projesi

Protein Yapilarinin Ağ Analizi İçin Web Tabanli Bir Araç Geliştirilmesi, Özbek Sarıca P. (Yürütücü) (2019 - 2020)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Majör Histokompatibilite Kompleks Proteinlerinin Peptit Bağlanma Afinite ve Kompleks Stabilitesinin Hesaplamalı Olarak Araştırılması, Özbek Sarıca P. (Yürütücü) (2018 - 2020)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Aporfin sınıfına ait alkaloitlerin in vitro ve in siliko yöntemlerle farklı sınıflara ait ilaç atım pompalarına inhibitör olarak değerlendirilmeleri, Özbek Sarıca P. , Sarıyar Akbulut B. (Yürütücü) (2017 - 2019)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Moleküler Dinamik Simülasyon Bazlı Sarsım Yöntemi ile Protein İçi Sinyal İletim Mekanizmasının Karakterizasyonu, Özbek Sarıca P. (Yürütücü)(2016 - 2018)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Computational Dynamical Characterization of Human Major Histocompatibility Complex Proteins, Özbek Sarıca P. (Yürütücü) (2015 - 2018)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Dynamic Characterization of Protein-protein Interfaces using Gaussian Network Model, Marmara University Research Fund Project, Özbek Sarıca P. (Yürütücü)(2014 - 2015)

 

• TÜBİTAK 3501 Projesi 

Dynamic Characterization of HLA Molecules, Özbek Sarıca P. (Yürütücü) (2013 - 2015)

 

• Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

Dynamic Characterization of Protein Binding Mechanism, Özbek Sarıca P. (Yürütücü)(2012 - 2013)

 

• TÜBİTAK Projesi

Proteinlerde Bağlanma Mekanizmasında Yapısal Dinamik, Özbek Sarıca P. , Haliloğlu T. (2009 - 2010)